La Corporación Universitaria Comfacauca fue posicionada como una de las cinco mejores, de 36 Instituciones de Educación Superior del país, en la categoría de Mejor experiencia de Innovación Educativa en Educación Superior, del Ministerio de Educación Nacional. La mención fue hecha mediante la convocatoria “Para identificar iniciativas y buenas prácticas en innovación educativa en educación superior 2020”